A unidade de Pronto Atendimento também é uma estrutura própria que funciona 24 horas por dia, sendo a porta de entrada para os casos de urgências e emergências médicas.

Utiliza-se o Protocolo de Acolhimento com Classificação Risco de Santa Catarina para assegurar a atenção médica de acordo com a necessidade apresentada pelo paciente e a urgência encontrada pelo profissional, priorizando os casos mais graves. A classificação é realizada por profissionais que possuem treinamento específico sobre o protocolo. Ao passar por esse acolhimento, o paciente recebe uma pulseira com uma das cinco cores existentes no protocolo, que significa a prioridade clínica do atendimento médico.